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大數據分析R語言Markdown的使用技巧
時間:2020-06-28來源:www.zhuozheng31.icu點擊量:作者:Sissi
時間:2020-06-28點擊量:作者:Sissi



  R Markdown是一種用于在R中生成可重復生成的報告的開源工具。它可以幫助您將所有代碼,結果和編寫都放在一個地方,并以有吸引力且易于消化的方式格式化所有內容。
 

  這也是將您的數據工作展示給其他人的寶貴工具。使用R Markdown,您可以選擇將您的作品導出為多種格式,包括PDF,Microsoft Word,幻燈片或HTML文檔,以便在網站上使用。
 

  R Markdown是一種功能強大的工具,因為它可用于數據分析和數據科學,與他人合作以及將結果傳達給決策者。
 

  在大數據分析R語言Markdown的使用技巧中,我們將介紹在RStudio中使用R Markdown的一些技巧,竅門和快捷方式。(如果您想了解有關RStudio的更多信息,請查看此AAA教育博客文章,了解RStudio的提示和技巧!)
 

  我們喜歡使用R Markdown在R中進行編碼和創作內容。實際上,我們在R Markdown中撰寫了此博客文章!讓我們找出原因!
 

  一、鍵盤快捷鍵
 

  知道R Markdown鍵盤快捷鍵將在創建報告時節省大量時間。
 

  以下是一些基本的R Markdown快捷方式:
 

  1)Command + Option + I在Mac或Ctrl + Alt + ILinux和Windows 上插入一個新的代碼卡盤。

  2)Command + Shift + K在Mac或Ctrl + Shift + KLinux和Windows 上,以YAML標頭中指定的格式輸出文檔。“ k”是“編織”的縮寫!

  接下來,我們將介紹運行代碼塊的快捷方式。但是在執行此操作之前,通常最好重新啟動R會話并從干凈的環境開始。Command + Shift + F10在Mac或Ctrl + Shift + F10Linux和Windows 上執行此操作。

  3)Command + Option + P在Mac上運行當前塊上方的所有塊;Ctrl + Alt + P在Linux和Windows上。

  4)在Mac 上Command + Option + C或Command + Shift + Enter在Mac上運行當前塊;Ctrl + Alt + C或Ctrl + Shift + Enter在Linux和Windows上。

  5)Command + Option + N在Mac上運行下一個塊;Ctrl + Alt + N在Linux和Windows上。

  6)在Mac 上Command + Option + R或Command + A + Enter在Mac上運行所有塊;Ctrl + Alt + R或Ctrl + A + Enter在Linux和Windows上。
 

  二、快速預覽您的文檔
 

  R Markdown提供了許多用于編譯文檔的格式選項。但是,將您的工作呈現為PDF或演示文稿的時間可能比編譯為HTML所需的時間長得多。因此,創作時將文檔輸出為HTML通常很有用,因為這樣可以快速進行迭代。
 

  當打開一個新的R Markdown文件時,默認的輸出格式是HTML-編譯報告時,您可以在Web瀏覽器中輕松查看它。此默認設置可以節省您的時間!當您接近成品時,可以將輸出更改為您選擇的格式,然后進行最后的修飾。

大數據分析
 

  三、知道您的代碼塊選項
 

  R Markdown的一大優點是,您有許多選擇來控制如何評估和呈現每個代碼塊。這使您可以從頭開始構建演示文稿和報告,包括代碼,圖表,表格和圖像,同時僅將基本信息呈現給目標受眾。例如,您可以包含結果圖,而不顯示用于生成結果的代碼。
 

  掌握以下代碼塊選項對于成為熟練的R Markdown用戶至關重要:
 

  1)echo = FALSE:隱藏代碼,但運行代碼并產生所有輸出,曲線圖,警告和消息。

  2)eval = FALSE:顯示代碼,但不對其進行評估。

  3)fig.show = "hide":隱藏圖。

  4)include = FALSE:運行代碼,但不顯示所有輸出。這對于設置代碼很有幫助。打開新的R Markdown文檔時,您可以在第一個代碼塊中看到一個示例!

  5)message = FALSE:防止軟件包在加載時打印消息。這也抑制了函數生成的消息。

  6)results = "hide":隱藏打印輸出。

  7)warning = FALSE:防止軟件包和功能顯示警告。
 

  四、使用內聯代碼
 

  使用內聯代碼將R代碼直接嵌入到R Markdown文檔中。當您要在書面摘要中包含有關數據的信息時,這很有用。
 

  將內聯代碼與一起使用,r并添加代碼以在反引號內進行評估。例如在編寫大數據分析R語言Markdown的使用技巧時,我們使用了內聯代碼來自動為每個部分編號,因此我們不必自己手動添加它們。那么我們如何做到的呢?我們首先tip_number在setup代碼塊中創建一個名為和的變量,然后將值設置為零,如下所示:

大數據分析
 

  然后,將以下內聯代碼添加到每個部分,以使每次迭代的數目增加一:

大數據分析
 

  嘿,等一下!我們如何在R Markdown中撰寫的此博客文章中包含最后一行代碼,而不弄亂下面的部分編號?帶有代碼塊選項!上面的代碼示例以代碼塊形式編寫,帶有eval = FALSE用于阻止代碼運行的選項。像這樣:

大數據分析
 

  如您所見,R Markdown是一個功能強大的工具,因為它可以使您對文檔輸出進行很多控制!
 

  五、使用TinyTex
 

  使用R Markdown,您可以使用LaTeX文檔準備系統輸出高質量的報告。當報告包含科學或數學符號以及符號時,LaTeX特別有用。例如,我們在AAA教育中使用LaTeX編寫使用數學符號的統計內容。
 

  但是,諸如TeX Live,MiKTeX和MacTeX之類的LaTeX發行版在您的硬盤驅動器上需要大約5 GB的磁盤空間!相反,TinyTex在安裝時僅使用約150 MB。
 

  使用install.packages('tinytex')或安裝TinyTex tinytex::install_tinytex()。使用卸載TinyTex tinytex::uninstall_tinytex()。
 

  安裝TinyTex后,如果您將PDF指定為輸出格式,則無需執行其他操作即可輸出PDF文檔!
 

  要編譯一個LaTeX文檔為PDF格式,調用其中的一個tinytex功能:pdflatex(),xelatex(),和lualatex()。使用的功能取決于您要使用的LaTeX引擎。
 

  TinyTex開發人員和R Markdown超級巨星謝益輝說,這是普通R用戶需要了解的所有有關TinyTex的信息。為什么?因為提到的LaTeX功能將自動檢測并安裝所有缺少的LaTeX軟件包!
 

  六、使用R腳本生成R Markdown文檔
 

  您是否知道可以從R腳本生成R Markdown文檔?為此,請使用捕獲注釋#'。您甚至可以使用來指定代碼塊選項#+。這是一個例子:
 

  該R腳本以文件名“ r_script.R”保存。為了將此文檔呈現為R Markdown文檔,我們spin()從中指定函數knitr,如下所示:
 

  knitr::spin("r_script.R", knit = FALSE, format = "R
md")
 

  這將生成一個R Markdown文檔,如下所示:

大數據分析

 

  當您編織此文檔時,將返回以下HTML輸出:

大數據分析
 

  七、生成帶有R Markdown文檔的R腳本
 

  您可能想知道是否存在將R Markdown文檔轉換為R Script的方法?有!該knitr軟件包還為此提供了一個功能purl()。這是將我們的R Markdown文檔轉換回R腳本的命令:
 

  knitr::purl("r_script.Rmd", documentation = 2)
 

  請注意,您必須指定documentation = 2返回#'注釋中的完整文檔。如果您的文檔是純代碼,請指定documentation = 0。
 

  八、在R Markdown中添加換行符
 

  在輸出中添加換行符有多困難?不是。但是弄清楚這一點可能有點棘手!
 

  要在R Markdown中打斷一行并將其顯示在輸出中,請使用兩個尾隨空格,然后單擊return。讓我們來看一個例子。
 

  在這里,我們沒有在第一(頂部)組的兩個句子之間指定兩個尾隨空格。但是我們確實在第二個(底部)組的兩個句子之間指定了兩個尾隨空格。
 

  編織文檔后的結果?看看這個!
 

  九、在R Markdown中添加空白行
 

  因為我們只介紹了換行符,所以我們還討論如何在文檔中添加空行。當您要添加空格以減少文檔中的混亂時,此功能很有用。
 

  要在輸出中顯示一個或多個空行,請指定。讓我們來看一個例子。
 

  在這里,我們沒有
 

  在第一(頂部)組的兩個句子之間指定兩個命令。但是我們確實
 

  在第二個(底部)組的兩個句子之間指定了兩個命令。

大數據分析
 

  結果就是這里!

大數據分析
 

  十、在R Markdown中查詢SQL
 

  您可以通過創建{sql}代碼塊在R Markdown中查詢SQL 。
 

  首先,將生成一個內存中的SQL數據庫以供本示例使用。您將生成一個著名的“ mtcars”數據集的SQL數據庫。這是代碼:
 

  在新的代碼塊中,編寫一個SQL查詢以使用四缸引擎從數據庫中選擇所有汽車。確保將此塊的類型更改為{sql}。此命令返回一個數據框,您將另存為mt_cars_df:
 

大數據分析
 

  指定output.var = "mt_cars_df"將查詢結果保存到數據框。數據框如下所示:


大數據分析
 

  您可以在R代碼塊中使用此數據幀來執行分析或生成ggplot,例如:

大數據分析
大數據分析
 

  十一、使用塊名稱
 

  命名代碼塊對于包含許多塊的長文檔很有用。例如,使用R代碼塊,將塊命名為:{r my_boring_chunk_name}。
 

  使用命名的代碼塊,您可以在R Markdown窗口窗格底部包含的代碼塊導航器中的塊之間進行導航。這也可以使圖易于按名稱標識,因此可以在文檔的其他部分中使用它們。
 

  我們已經從上面在SQL示例中添加了塊名稱。這是我們在導航器中看到的內容:
 

  十二、將它帶到云端!
 

  RStudio現在提供了一個基于云的RStudio Desktop版本,稱為RStudio Cloud。RStudio Cloud允許您在R Markdown中進行創作,而無需安裝軟件,只需要一個Web瀏覽器。
 

  RStudio Cloud中的工作被組織成與桌面版本相似的項目,但是RStudio Cloud使您可以指定希望用于每個項目的R版本。
 

  RStudio Cloud還可以輕松安全地與同事共享項目,并確保每次訪問項目時都可以完全重現工作環境。這對于在R Markdown中編寫可重復生成的報告非常有用!
 

  如您所見,RStudio Cloud的布局與在RStudio桌面中編寫R Markdown文檔非常相似:
 

  獎勵:R Markdown備忘單
 

  RStudio已發布了許多與R一起使用的備忘單,包括有關使用R Markdown的詳細備忘單!通過選擇,可以從RStudio中訪問R Markdown備忘單Help > Cheatsheets > R Markdown Cheat Sheet。
 

  其他資源
 

  RStudio已發布了一些有關如何使用R Markdown的文章。

 

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